Sous le règne de Rodolphe Ier, deux branches cadettes se détachent de la Maison de Habsbourg: les comtes de Habsbourg-Laufenbourg et de Neu-Kybourg. Ils disposent de leurs propres domaines seigneuriaux et s'efforcent en vain d'affirmer leur autonomie face à la branche principale de la Maison de Habsbourg-Autriche. Les Habsbourg-Laufenbourg obtiennent les biens familiaux du Fricktal, du sud de la Forêt Noire et d'Unterwald. Les Neu-Kybourg reçoivent les possessions héritées des comtes de Kybourg dans la Haute-Argovie avec les centres de Thoune et de Berthoud. Ces deux branches comtales s'éteignent vers 1400. Le Fricktal des Habsbourg-Laufenbourg passe aux Habsbourg d'Autriche, et la possession de Neu-Kybourg est absorbée par le territoire grandissant de la ville de Berne confédérée.